Une nouvelle technologie peut détecter des centaines de protéines dans un seul échantillon

Anonim

Une nouvelle technologie mise au point par une équipe de scientifiques de l’Université McGill montre qu’il est possible de rationaliser l’analyse des protéines, en offrant aux hôpitaux et aux laboratoires de recherche un outil rapide, à volume élevé et rentable.

Les protéines présentes dans le sang fournissent aux scientifiques et aux cliniciens des informations clés sur notre santé. Ces marqueurs biologiques peuvent déterminer si une douleur thoracique est causée par un événement cardiaque ou si un patient a un cancer.

Malheureusement, les outils utilisés pour détecter ces protéines n'ont pas beaucoup évolué au cours des 50 dernières années. Malgré la présence de plus de 20 000 protéines dans notre organisme, la grande majorité des tests protéiques effectués aujourd'hui ne visent qu'une seule protéine à la fois.

Maintenant, Ph.D. Le candidat Milad Dagher, le professeur David Juncker et ses collègues du Département de génie biomédical de McGill ont conçu une technique capable de détecter des centaines de protéines avec un seul échantillon de sang.

Une partie de leur travail, qui vient d'être publié dans Nature Nanotechnology, décrit une nouvelle méthode améliorée pour coder des micro-billes à l'aide de colorants fluorescents multicolores. En générant plus de 500 microbilles de couleurs différentes, leur nouvelle plate-forme de codes à barres permet de détecter des marqueurs en parallèle à partir de la même solution. Par exemple, un code à barres bleu peut détecter le marqueur 1, tandis qu'un code à barres rouge détecte bientôt. Un instrument à base de laser appelé cytomètre compte alors les protéines qui adhèrent aux différentes perles colorées.

Bien que ce type de méthode d’analyse soit disponible depuis un certain temps, l’interférence entre les colorants multicolores a limité la possibilité de générer les bonnes couleurs. Désormais, un nouvel algorithme développé par l'équipe permet de générer avec une grande précision différentes couleurs de microbilles, un peu comme une roue chromatique peut être utilisée pour prédire le résultat du mélange des couleurs.

L'équipe du professeur Juncker espère tirer parti de sa plate-forme pour améliorer l'analyse des protéines.

"Les technologies actuelles ont un compromis majeur entre le nombre de protéines pouvant être mesurées à la fois et le coût et la précision d'un test", explique Dagher. "Cela signifie que les études à grande échelle, telles que les essais cliniques, sont insuffisantes car elles ont tendance à utiliser des plates-formes éprouvées avec des capacités limitées."

Leur travail à venir se concentre sur le maintien d'une détection précise des protéines à une échelle accrue.

"Le modèle FRET de l'Ensemble multicolore permet un codage à des niveaux FRET extrêmes" par Milad Dagher, Michael Kleinman, Andy Ng et David Juncker ont été publiés dans Nature Nanotechnology.

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