Deux études sans rapport ont abouti à la découverte d'inhibiteurs de CRISPR-Cas12a

Anonim

Deux équipes travaillant indépendamment les unes des autres ont identifié plusieurs inhibiteurs CRISPR-Cas12a. La première équipe était composée de membres de l’Université de Californie à Berkeley, l’autre de membres du Massachusetts General Hospital et de l’Université de Californie. Les deux ont utilisé des outils bioinformatiques pour analyser les génomes bactériens à la recherche d'inhibiteurs possibles et ont tous deux publié leurs résultats dans la revue Science .

CRISPR est une technique d'édition de gènes capable d'identifier des segments d'ADN et de les extraire d'un génome. Il peut également être utilisé pour remplacer des segments qui ont été découpés. Pour remplir ses fonctions, CRISPR utilise une protéine nucléase pour servir de guide ou de modèle, décrivant quels gènes doivent être coupés et / ou remplacés. Cas9, souvent utilisé à cette fin dans de nombreuses études antérieures, a été associé à la technique. Mais pour que Cas9 fonctionne correctement, les chercheurs ont également dû ajouter un inhibiteur de la Cas9. Son travail consistait à empêcher les coupures étrangères. Plus récemment, les chercheurs ont utilisé Cas12a car il offre d'autres caractéristiques souhaitées que l'on ne trouve pas dans Cas9. Mais jusqu'à présent, il n'existait aucun inhibiteur connu pour Cas12a, qui entravait son utilisation dans les efforts de recherche. Dans ces deux nouveaux efforts, les deux équipes ont découvert que plusieurs inhibiteurs, selon eux, conviennent à une utilisation avec CRISPR.

Les deux équipes ont utilisé une approche de pipeline bioinformatique pour rechercher les inhibiteurs de Cas12. Il s'agit d'un système de recherche dans les génomes bactériens consistant à rechercher des fragments génétiques qui sont normalement mortels pour les bactéries mais pas à des bactéries inhibitrices. En utilisant cette approche, la première équipe a trouvé trois inhibiteurs, dont un qui s’appelait AcrVA1. Des tests avec des cellules humaines ont montré que tous les trois pouvaient être utilisés avec CRISPR. En utilisant la même approche de base, la deuxième équipe a trouvé plusieurs candidats qui ont également fonctionné comme espéré lors de tests avec des cellules humaines. La deuxième équipe a également constaté que AcrVA1 était particulièrement efficace.

Pris ensemble, le travail des deux équipes a permis d’obtenir plusieurs inhibiteurs de Cas12a, dont l’un semble particulièrement prometteur. Et cela pourrait mener à des recherches plus fructueuses en utilisant CRISPR-Cas12a comme nouvel outil d'édition de gènes.

menu
menu